Mikrofotografie a analýza obrazu v biologii (LRR / MIKAN)

Cíle předmětu (anotace):

Způsoby pořizování obrazových dat v biologii a využití analýzy obrazu.

Požadavky na studenta

80% úspěšnost u kolokvia

Obsah

Způsoby pořizování obrazových dat v biologii a využití analýzy obrazu. Zahrnuje současná dokumentační zařízení, klasické a digitální fotoaparáty, TV a digitální kamery, digitalizace signálu. Makrofotografie a mikrofotografie. Základy počítačové grafiky, software a hardware. Pořizování a archivace obrazových dat, principy manuálního a automatického měření biologických objektů. Předzpracování a zpracování obrazu, binární editor. Základy klasifikace objektů. Mikroskopické techniky světelné, fluorescenční a elektronová mikroskopie.

Aktivity

Garanti a vyučující

Garanti: doc. RNDr. Vladimír Kryštof, Ph.D.,
Přednášející: Mgr. Ota Blahoušek, Mgr. Jiří Grúz, Ph.D., doc. RNDr. Vladimír Kryštof, Ph.D., Mgr. Martin Mistrík, Ph.D.,
Vede seminář: Mgr. Ota Blahoušek, doc. RNDr. Vladimír Kryštof, Ph.D., Mgr. Martin Mistrík, Ph.D.,

Literatura

Doporučená: Harnischmacher, C. Closeup Shooting: A Guide to Closeup, Tabletop and Macro Photography. Rocky Nook, 2007.
Doporučená: Georges, G. Digitální fotografie: 100 praktických návodů a tipů. Computer Press, 2005.
Doporučená: Thompson, R. Naučte se fotografovat dobře makro a detail. Zoner Press, 2006.
Doporučená: John C. Russ. The Image Processing Handbook, CRC Press, 2010..
On-line katalogy knihoven

Předpoklady – další informace k podmíněnosti studia předmětu

Seznámit se se způsoby pořizování obrazových dat v biologii a analýzy obrazu.

Získané způsobilosti

Znát a vysvětlit: Způsoby pořizování obrazových dat v biologii a využití analýzy obrazu. Zahrnuje současná dokumentační zařízení, klasické a digitální fotoaparáty, TV a digitální kamery, digitalizace signálu. Makrofotografie a mikrofotografie. Základy počítačové grafiky, software a hardware. Pořizování a archivace obrazových dat, principy manuálního a automatického měření biologických objektů. Předzpracování a zpracování obrazu, binární editor. Základy klasifikace objektů. Mikroskopické techniky světelné, fluorescenční a elektronová mikroskopie.

Vyučovací metody

Přednášení
Demonstrace

Hodnotící metody

Rozbor produktů pracovní činnosti studenta (technické práce)